Ранние годы и образованиеЧойбалсан родился в хошуне Ачиту-вана Сэцэн-ханского аймака во Внешней Монголии у аратки Хорло третьим из сыновей. Отец доподлинно неизвестен, однако считается, что им был некий даур Жамц. Как незаконнорожденный, Чойбалсан вместо отчества стал известен по матрониму Хорлогийн. С 7 лет стал изучать тибетский язык; в 13 лет был отдан родственниками матери в буддийский монастырь хошуна Сан-бэйсэ, где и получил религиозное имя «Чойбалсан». Отчасти в качестве сокращения от этого имени, отчасти из-за характера получил прозвище Чоно (волк). По монгольским представлениям волк - олицетворение ловкости, выносливости, энергии и ума. Приехав домой на лето 1910 года, вместе со своим товарищем Гэндэн-Яринпилом бежал в Ургу, где устроился чернорабочим. С 17 лет поступил в школу русской и монгольской письменности, основанную после национальной революции новообразованным МИДом Монголии. Затем, в период 1914-1917 годов, вместе с ещё 8 юношами-монголами, обучался в Иркутском учительском институте, где выучил и немецкий язык.
Революционная деятельностьВ 1919 году вступил в революционный кружок Бодо, объединение которого в 1920 году с аналогичным кружком Сухэ-Батора положило начало Монгольской народно-революционной партии (МНРП).
С 1920-х годов занимал руководящие должности в революционном движении.
Государственная карьераПосле победы Монгольской народной революции 1921 года - и в военных и политических структурах Монголии, важнейшие из которых:
- главнокомандующий Монгольской Народно-Революционной армией (1924-1929 и 1937-1952)
- Председатель Президиума Государственного Малого Хурала (1929-1930)
- министр иностранных дел (1930)
- министр животноводства и земледелия (1931-1935)
- министр внутренних дел (1936-1939)
- первый заместитель премьер-министра (1935-1939)
- глава правительства (Председатель Народного Совета министров и Председатель Совета министров) (1939-1952)
Чойбалсан был последовательным сторонником Сталина и членом ВКП(б). Воспользовавшись тем, что глава Монголии Пэлжидийн Гэндэн утратил доверие Сталина (в частности, из-за того, что отказался провести массовые репрессии против буддийских монахов и форсировать введение централизованной экономики), в 1936 году Чойбалсан содействовал его отстранению от власти, вскоре после этого Гэндэн был арестован и отправлен в СССР, где в 1937 году был расстрелян. Чойбалсан, бывший в 1935-1939 первым заместителем премьер-министра, до 1939 года формально не занимал высшей должности в правительстве, однако фактически уже в 1936 году стал диктатором и провёл массовые репрессии, уничтожив не только своих противников в партии, но также большое число бывших аристократов, монахов и пр. В результате репрессий погибло 20-25 тысяч человек, то есть несколько процентов населения страны.
Комкор Жуков и маршал Чойбалсан
Чойбалсан возглавлял монгольскую армию в совместных с РККА операциях на Халхин-Голе и в советско-японской войне.
Смерть Чойбалсана в 1952 году сопровождалась очередным витком культа его личности - его тело было помещено в мавзолей, его имя было увековечено, в частности, переименованием крупнейшей горы в столице Монголии.
В 1956 году под влиянием политических процессов в СССР политическая деятельность и культ личности Чойбалсана были подвергнуты критике в докладе Ю. Цэдэнбала на съезде Монгольской народно-революционной партии. Однако его статуи не были снесены, а административный центр аймака Дорнод до настоящего времени носит его имя.
Тело Чойбалсана, с 1952 года находившееся в Мавзолее Сухэ-Батора и Чойбалсана, перезахоронено в 2005 году на государственном мемориальном кладбище Улан-Батора.