Родился 17 августа 1897 года в семье известного британского писателя Редьярда Киплинга и его жены Кэролайн Киплинг. Был третьим и самым младшим ребёнком в семье.
Благодаря связям отца получил образование в Колледже Веллингтона - одном из самых престижных учебных заведений Великобритании того времени.
Первая мировая война4 августа 1914 года Великобритания объявила себя находящейся в состоянии войны с Германской империей. На тот момент Джону Киплингу было всего 16 лет. Придерживающийся империалистических и патриотичных взглядов, Киплинг-старший стал ярым сторонником войны и начал писать пропагандистские листовки от имени Британского правительства. В то же время Джон Киплинг также поддерживающий взгляды своего отца, решил завербоваться в Королевский военно-морской флот Великобритании. Отец был единственным из членов семьи, кто поддержал идею сына, но врачебная комиссия признала Киплинга-младшего негодным к службе на флоте, по причине очень плохого зрения. Тогда Джон подал заявку на вступление в пехоту вооруженных сил Великобритании, но и там ему отказали по аналогичным причинам.
Узнав об отказе принять его сына в армию, Редьярд Киплинг был очень расстроен, и решил подключить свои связи в правительстве. Благодаря личной дружбе с Фельдмаршалом Британской армии, графом Фредериком Робертсом ему удалось записать сына в армию. В день своего семнадцатилетия - 17 августа 1914 года Джону Киплингу было присвоено звание второго лейтенанта (Лейтенант в других странах), и он был приписан к 2 батальону Ирландской гвардии входящему в состав Британской армии. Летом 1915-го, После падения Бельгии, и гибели Лузитании 7 мая 1915 года, Киплинг старший лично отправился на линию фронта, в качестве военного корреспондента. В это же время он написал прошение о скорейшем отправлении его сына на фронт, так как считал, что Джон должен увидеть настоящую войну.
В середине августа 1915 года батальон Джона Киплинга был переброшен на фронт во Францию. В то время процент потерь среди младшего офицерского состава был наивысочайшим за всю войну. Средняя продолжительность жизни офицера на линии фронта составляла 5 - 6 недель.
С 25 сентября 1915 года Джон Киплинг командовал взводом в битве при Артуа.
ГибельОфициально, днем 27 сентября 1915 года пропал без вести во время боя с немцами недалеко от местечка Лос-ан-Гоэль, во Франции. Однако есть две версии гибели Джона Киплинга:
Согласно первой, рядом с Киплингом разорвался немецкий артиллерийский снаряд, и осколками ему снесло часть черепа, в результате чего и наступила смерть. Это объясняет и тот факт, почему его тело не было опознано среди убитых после боя.
Согласно второй, и более распространенной версии, Киплинг вместе с ещё несколькими солдатами попытались уничтожить немецкое пулеметное гнездо обстреливавшее британские позиции с одной из возвышенностей. В ходе атаки все британские солдаты погибли. Киплинг же получил ранения в ногу, грудь, плечо и легкое и скончался от полученных ранений самым последним из своего отряда. Его тело лежало почти вплотную к пулеметному гнезду, и британцы не смогли забрать его. Из-за чего Киплинга объявили лишь пропавшим без вести, а не мертвым.
7 октября 1914 года The Times опубликовала сообщение о ранении и пропаже сына Киплинга. Джон Киплинг был официально объявлен мертвым лишь в 1992 году.