Ранние годыСултан Меджид Эфендиев родился 26 мая 1887 года в Шемахе в семье торговца Меджида Эфендиева и был внуком закавказского муфтия. Первоначальное он обучался в мектебе, но затем отец перевёл его в шемахинское трёхклассное училище. Торговые дела у отца шли неважно, а после шемахинского землетрясения 1902 года и вовсе оказались подорваны, после чего отец решает переехать в Баку. В Баку Султан Меджид Эфендиев был определён в шестиклассное училище, где он впервые знакомится с марксизмом. В 1904 году он вступает в РСДРП(б) и становится одним из организаторов социал-демократической организации Гуммет, принимает участие в Революции 1905-07 годов.
В 1915 году Эфендиев окончил медицинский факультет Казанского университета и в том же году поступил на работу в посёлке Васильсурск Нижегородской губернии в качестве врача врачебно-наблюдательного пункта. В следующем году его перевели на работу во Владимировку, находящейся в 250 верстах к северо-западу от Астрахани. После Февральской революции 1917 года - член Бакинского совета, комитета «Гуммет», комитета РСДРП(б). С 1918 года С. М. Эфендиев участвует в обороне Астрахани, комиссар по делам мусульман Закавказья при Наркомнаце РСФСР и заместитель председателя Центрального бюро коммунистических организаций народов Востока при ЦК РКП(б).
Мемориальная доска на стене дома в Баку, в котором с 1921 по 1937 год жил Султан Меджид Эфендиев
В период с 1920 по 1921 годы был членом Исполкома Бакинского совета, чрезвычайным уполномоченным ЦК Азербайджанской КП(б) и комиссаром Гянджинской губернии. В 1921-1924 гг. - член ЦИК, наркомзем, нарком РКИ Азербайджанской ССР.В 1924-1927 годах на должности председателя ЦКК Азербайджанской КП(б).С 1927 г. работает заместителем председателя, а с 1931 - председателем ЦИК Азербайджанской ССР и один из председателей ЦИК ЗСФСР.
Был делегатом XII и XIII съездов РКП(б), в 1924-27 годы член ЦКК ВКП(б).Был членом Заккрайкома ВКП(б), Бюро Азербайджанской КП(б), член ЦИК СССР. 28 января 1932 года постановлением II-й сессии ЦИК ЗСФСР VI-го созыва Эфендиев был назначен председателем ЦИК ЗСФСР.
Арест и казньВ мае 1937 года на XXII Бакинской партийной конференции Султан Меджид Эфендиева обвинили в укрывательстве врагов Советской власти. По итогам конференции была принята резолюция, куда был включён пункт о неискреннем поведении С. М. Эфендиева, Г. Султанова и других коммунистов и о расследовании их «дела». Во время своего выступления на заседании XIII съезда Коммунистической партии Азербайджанской ССР, состоявшемся 5 июня того же года, С. М. Эфендиев отверг выдвинутые против него обвинения. Присутствующие на заседании Багиров и Сумбатов-Топуридзе потребовали от него признания в антисоветской, контрреволюционной деятельности. Главной виной Багиров назвал то, , что «Вы послали в Москву так называемых своих родственников в кавычках, дав им заявление на руководство ЦК КП(б) Азербайджана». В ходе прений Багиров вспомнил о публицистической деятельности Эфендиева, в частности то, что он в одной из своих статей в 1924 году упомянул фамилию Расулзаде. С. М. Эфендиев объяснял это требованием соблюдения «исторической правдивости», в ответ на что Багиров заявил: «Товарищи, чей это язык? Товарищи, это язык Троцкого». С обвинениями выступили и другие делегаты съезда. Так, председатель Совнаркома республики Усейн Рахманов говорил: «Эфендиев пытался признать своим вождём самого злейшего врага азербайджанского народа Мамеда Эмина Расулзаде. Иначе нельзя объяснить, почему он называл Расулзаде своим товарищем... Называть своим товарищем и считат, что он вёл борьбу в бакинской организации по умиротворению так называемой национальной вражды - это является чистейшей контрреволюционной выходкой и она не случайна со стороны Эфендиева». В ходе съезда С. М. Эфендиев заявил: «...Я в партии 33 года. За эти 33 года я беспорочно работал в партии и меня никакой клеветой и провокацией погубить нельзя».
24 июня Султан Меджид Эфендиев был арестован органами НКВД. Тогда же в конце месяца председатель ЦИК СССР М. И. Калинин запросил обстоятельства дела С. М. Эфендиева, но М. Д. Багиров сообщил, что тот снят с должности и арестован за контрреволюционную деятельность. По показаниям свидетелей он подвергался жестоким избиениям со стороны сотрудников азербайджанского НКВД (Ю. Д. Сумбатова, Цинмана, Гвоздева и Сонькина), требовавших от него необходимых им показаний. Тем не менее он долго держался, не давая требуемых показаний. По свидетельству Д. П. Возничука, работавшим старшим надзирателем тюрьмы, «…жестоким избиениям подвергались председатель ЦИК Эфендиев, быв. сотрудник органов Павлов. Причём Эфендиева били так сильно, что после допросов он мог только лежать…». Бывший оперуполномоченный НКВД Азербайджана В. М. Дудиев рассказывал: «Однажды я зашёл в кабинет Сонькина или Ермакова - точно не помню, - там находился оперуполномоченный Мусатов Николай (боксёр), нач. отдела Цинман, нарком Сумбатов и ещё кто-то из работников. Из арестованных в кабинете был Эфендиев Султан Меджид, он сидел на полу в разованной рубашке, весь избит. Его кто-то из следователей обливал водой и приводил в чувство, а другой в это время говорил ему: "Давай показания..."». Другой свидетель Х. П. Халдыбанов показал: «лично видел, как Цинман и Мусатов Коля допрашивали председателя президиума Верховного Совета Азербайджанской ССР Эфендиева С. М. и избивали его. Причём Цинман оскорблял Эфендиева, презрительно называл его президентом». По утверждению других свидетелей, когда С. М. Эфендиев пожаловался на действия следователей, Цинман нанёс ему удар кулаком в лицо и вышел, после чего следователи продолжили избиение. Наконец, 16 августа 1937 года Цинман оформил акт:
Привлечённый к следствию обвиняемый Султан Меджид Эфендиев сообщил, что хотя не участвовал в контрреволюционной деятельности, но, учитывая сложившуюся политическую ситуацию, готов дать показания о своём участии в националистической контрреволюционной организации.
21 апреля 1938 года Военная коллегия Верховного суда СССР приговорила С. М. Эфендиева к расстрелу. Приговор был приведён в исполнение.