Йоаннетта - одна из трёх дочерей Геррита и Петро Крюгеров. Её старшую сестру зовут Ронель (ныне пастор в одном из приходов в ЮАР), а младшую - Этресия (в детстве также играла в теннис, но ныне работает менеджером по маркетингку в Хилтон-Хед-Айленде, США).
В ноябре 2001 года южноафриканка вышла замуж за Абри Крюгера.
Йоаннетта пришла в теннис в 6 лет при поддержке матери, которая затем долгое время помогала дочери в тренировочном процессе.
Личные турнирыКрюгер дебютировала на соревнованиях профессионального тура в 1989 году, сыграв серию соревнований ITF в ЮАР и Израиле. Уже здесь она впервые добралась до финала одиночного турнира, который, правда, уступила; после чего впервые получила место в одиночном рейтинге. На следующий год первый титул всё же был завоёван: участвуя в соревнованиях в Великобритании, Йоаннетта победила на одном из грунтовых 10-тысячников.
Некоторое время южноафриканка без особого успеха участвовала в мелких турнирах ITF, стабильно держась в рейтинге в четвёртой сотне, но поздней осенью 1991 года она постепенно вновь стала прогрессировать: несколько полуфиналов и четвертьфиналов 25-тысячников подняли её к маю следующего года в Top200, что позволило южноафриканце на Roalnd Garros дебютировать в квалификации соревнований серии Большого шлема: с первой же попытки удалось дойти до финала отбора. Несколько титулов на европейских грунтовых 25-тысячниках в летний период позволяют Йоаннетте дополнительно закрепиться на этих позициях, а серия локальных успехов на грунтовых соревнованиях до конца года позволяют к Australian Open-1993 набрать достаточный рейтинг, чтобы сразу попасть в основу одиночного турнира и войти в Top100.
На закрепление на новом уровне уходит чуть более года: лишь к весенней грунтовой серии южноафриканка набрала достаточную уверенность в своих силах, чтобы на равных играть и побеждать многих игроков из первой сотни рейтинга. Во время североамериканской серии соревнований на зелёном грунте Крюгер дважды проходит из квалификации во второй раунд основы, обыграв сначала Энн Вундерлих, а затем Бренду Шульц; здесь же проведён упорный трёхсетовый матч с Кончитой Мартинес. Набранная уверенность позволила улучшать свои результаты и дальше: уже в Европе Йоаннетта доходит до третьего круга сначала в Риме, а затем на Roland Garros (во Франции её путь пересёкся со Штеффи Граф и Крюгер смогла взять у тогдашней первой ракетки мира сет, что на столь ранних стадиях в матчах против немки никому не удавалось с 1985 года).
В следующие полтора года южноафриканка закрепляется в первой сотне рейтинга и даже, в какой-то момент входит в Top30. В феврале 1995 года выигран первый одиночный титул WTA - на соревнованиях в Пуэрто-Рико на пути к одиночному кубку переиграны три сеяные соперницы. В 1996 году из-за серии травм Крюгер выпадает из привычных игровых кондиций, часто проигрывает и сыграв после весеннего турнира в Мадриде лишь три соревнования выпадает из первой сотни рейтинга. За несколько месяцев паузы все травмы удалось вылечить и к весенней грунтовой серии 1997 года южноафриканка вернулась к прежним игровым возможностям: на трёх подряд европейских турнирах в Будапеште, Боле и Риме она доходит до четвертьфинальной стадии, записав на свой счёт победы над Брендой Шульц-Маккарти и Кариной Габшудовой. что позволяет ей и вернуться в Top100 и почуствовать прежнюю уверенность в своих силах. До конца года она возвращается в Top30. а также выигрывает свой второй одиночный титул WTA - на грунте Праги. На US Open того года южноафриканкап впервые в своей карьере пробивается в четвёртый круг одиночных соревнований Большого шлема.
В 1998 году дачная серия продолжилась: добыв финал соревнований в Оклахоме, четвертьфинал в Индиан-Уэллсе (здесь единственный раз в карьере обыграна соотечественница Аманда Кётцер) и полуфинал в Боле; Йоаннетта поднимается на высшую в своей карьере 21-ю строчку одиночного рейтинга. Конец того сезона вновь был ознаменован серией небольших травм: одна из них просто испортила часть сезона, а из-за другой Крюгер была вынуждена на полгода отказаться от игр и вернулась в строй лишь середине мая 1999 года. Возвращение былых кондиций отняло слишком много времени и к началу ноября южноафриканка провалилась в третью сотню рейтинга. Упав вниз она тем не менее нашла в себе силу подняться: полуфинал и четвертьфинал на восточноазиатской связке турниров WTA в Куала-Лумпуре и Паттайе позволяют вернуться в Top150, но от участия в Australian Open всё равно принято решение отказаться.
Уже на стартовом соревновании следующего года в бразильском Сан-Паулу Йоаннетта доходит до полуфинала, а в дальнейшем, за счёт успехов на 75-тысячниках в Уэст-Палм-Бич и Сарасоте, она возвращает себе место в Top100. Набранная уверенность позволяет сверкнуть на турнире в Берлине: Крюгер доходит до полуфинала местного соревнования первого круга, попутно выбив из сетки третью ракетку мира Натали Тозью. Немецкий успех не имел дальнейшего продолжения, но постепенно южноафриканка вернула былую стабильность результатов и до конца года ещё несколько раз побывала в четвертьфиналах соревнований WTA. Через год результаты удалось удержать на прежнем уровне, но большая часть очков зарабатывалась на второстепенных соревнованиях в начале или в конце сезона; на главных турнирах вновь удалось блеснуть во время весенней грунтовой серии: на этот раз в Риме был добыт четвертьфинал и по пути вновь удалось обыграть ту же Тозью. На этот же период приходятся два из трёх парных финалов Крюгер на турнирах WTA: в Сопоте, вместе с Франческой Скьявоне, она выиграла титул; а неделю спустя - в Базеле - Йоаннетта и Марта Марреро уступили в финале Марии Хосе Мартинес Санчес и Анабель Медине Гарригес (Анабель, в паре с Кристиной Торренс Валеро, до этого была повержена на польском турнире).
В начале 2002 года Крюгер вновь получила травму, которая выбила её из строя более чем на год. Вернувшись в тур в конце февраля 2003 года она сыграла пять турниров, но не одержав на них ни одной победы предпочла завершить игровую карьеру.
Сборная и национальные турнирыЙоаннетта дебютировала в национальной команде в Кубке Федерации в год её возрождения - в 1992 году. Некоторое время Крюгер находилась в сборной на вторых ролях, лишь время от времени заменяя в команде её тогдашних лидеров - Аманду Кётцер, Элну Рейнах и Мариан де Свардт. В общей сложности тренерский штаб сборной ЮАР задействовал Йоаннетту в шести сезонах Кубка Федерации, дав ей сыграть пятнадцать одиночных и пять парных встреч, в которых Крюгер было одержано шесть и три победы соответственно. В 1994 году сборная, при поддержке Крюгер, в последний раз на долгий период дошла до четвертьфинала Мировой группы (во втором круге Йоаннетта принесла южноафриканкам одно из двух победных очков в матче со сборной Нидерландов).
В 1996 году Крюгер представляла ЮАР на Олимпийских играх в Атланте, однако уступила уже в первом круге одиночного турнира.