Родился 29 ноября 1978 года в селе Верхний Жирим Республики Бурятия в семье семейских старообрядцев Забайкалья. Отец - Александр Кузьмич Китаев - лесничий Харитоновского лесничества. Мать - Евдокия Васильевна Китаева - библиотекарь.
По окончании Верхнежиримской средней школы исполнял послушание алтарника в Свято-Вознесенском храме города Улан-Удэ.
В 1996 году поступил в Белгородскую Православную Духовную семинарию (с миссионерской направленностью), которую окончил в 2000 году. Во время обучения участвовал в миссионерской экспедиции в Республику Саха-Якутия. Участвовал в съездах епархиальных миссионеров.
5 апреля 2001 года архиепископом Белгородским и Старооскольским Иоанном пострижен в монашество с именем Софроний.
7 апреля 2001 года рукоположён в сан иеродиакона, 12 апреля 2001 года - в иеромонаха.
Указом архиепископа Иоанна назначен благочинным храма святителя Иннокентия, митрополита Московского и Коломенского, и экономом Белгородской Православной Духовной семинарии и Православной гимназии святых Кирилла и Мефодия.
В 2002-2004 годах обучался на заочном секторе Киевской Духовной Академии.
В 2004 году Указом Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II награждён правом ношения наперсного креста.
В 2006 году защитил работу «Старообрядцы Забайкалья как составная часть духовного и этнокультурного потенциала Сибири» на степень кандидата богословия.
Принимал участи в миссионерских экспедициях по Сибири и Дальнему Востоку (2002 год), Калмыкии, Адыгее, а также миссионерской поездке на Камчатку.
В 2007 году по благословению митрополита Смоленского и Калининградского Кирилла, председателя ОВЦС, входил в состав официальной делегации в поездке в Индонезию.
В 2009 году по благословению Святейшего Патриарха Московского и Всея Руси Кирилла участвовал в праздновании 10-летия Православия в государстве Таиланд.
В 2010 году согласно Указу Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла был возведён в сан игумена.
31 мая 2010 года на заседании Священного Синода Русской Православной Церкви назначен наместником Свято-Троицкого Холковского мужского монастыря.
12 февраля 2011 года архиепископом Белгородским и Старооскольским Иоанном награждён, в связи с должностью наместника монастыря, игуменским посохом.
4 апреля 2011 года ко дню Святой Пасхи награждён правом ношения палицы.
18 октября 2011 года назначен официальным представителем Белгородской и Старооскольской епархии в органах государственной власти.
7 июня 2012 года на заседании Священного Синода Русской Православной Церкви избран епископом Губкинским и Грайворонским.
9 июня 2012 года в кафедральном Спасо-Преображенском соборе Белгорода архиепископом Иоанном (Поповым) возведён в сан архимандрита.
До епископской хиротонии являлся проректором по административно-хозяйственной части Белгородской Православной семинарии и преподавателем курса «Миссиология».
6 июля 2012 года в храме Всех святых, в земле Российской просиявших, Патриаршей резиденции в Даниловом монастыре в Москве наречён во епископа Губкинского и Грайворонского..
22 июля 2012 года в храме Преображения Господня в Тушине совершена хиротония архимандрита Софрония в сан епископа. Хиротонию совершили Патриарх Московский Кирилл, митрополит Крутицкий и Коломенский Ювеналий (Поярков), митрополит Саранский и Мордовский Варсонофий (Судаков), митрополит Воронежский и Борисоглебский Сергий (Фомин), митрополит Белгородский и Старооскольский Иоанн (Попов), архиепископ Курский и Рыльский Герман (Моралин), епископ Солнечногорский Сергий (Чашин).
С 25 августа 2014 года является заведующим кафедры миссиологии Белгородской Православной Духовной семинарии (с миссионерской направленностью).
Иногда совершает церковные службы дониконовским чином.