Владимир Могильников родился в Туле, в семье рабочих. Он окончил 9 классов школы № 21 и позже работал токарем на заводе «Штамп». С 1965 по 1968 год служил в пограничных войсках КГБ СССР. После службы Владимир Могильников работал слесарем на «Тульском комбайновом заводе», при этом учился в школе рабочей молодежи № 5, где закончил 11 классов.
В 1971 году его избрали секретарем комитета ВЛКСМ ТуКЗ. С 1971 по 1976 учился в Тульском филиале Всесоюзного финансово-экономического института. В 1976 году стал заведующим ЖКО Пролетарского райисполкома, а в 1979 году был избран заместителем председателя райисполкома. С 1982 года работал на «Тулачермете», где в 1986 году стал заместителем генерального директора предприятия по общим вопросам и быту.
В 1989 году Владимира Могильникова избрали председателем исполнительного комитета Пролетарского районного Совета народных депутатов Тулы. С 1992 года стал главой администрации Пролетарского района Тулы. В 2002 г. защитил кандидатскую диссертацию, кандидат педагогических наук. С 13 июля 2005 года избран исполнительным директором управы - первым заместителем главы города Тулы. С 12 ноября 2005 года стал главой муниципального образования «Город Тула» и председателем Тульской городской думы.
3 марта 2010 года в ходе заседания президиума политсовета партии «Единая Россия» Владимир Могильников подал в отставку. Причиной ухода он назвал нежелание принимать участие в предвыборной грязи, а также из-за поступавших в его адрес угроз.
С 2012 года Почетный президент Федерации бокса Тульской области.