В 1898 году окончил Петербургский университет. Ученик А. Е. Фаворского.
С 1899 году работал в Петербургском технологическом институте.
С 1903 года читал курс химии в Петербургском технологическом институте. Профессор (с 1930 года).
Преподаватель Высших Женских Политехнических курсов (в 1915 году преобразованы в Женский Политехнический институт, в 1918 году - во Второй Петроградский Политехнический институт).
12 декабря 1917 года Совет Пермского университета избрал приват-доцента Петроградского университета Ю. С. Залькинда на должность ординарного профессора по кафедре химии.
В июне 1918 года вместе с профессорами В. Э. Крусманом, М. В. Птухой, Б. Д. Грековым и ст. ассистентом Гульбисом был командирован в Москву на съезд деятелей высших учебных заведений по вопросам реформы высшей школы. А 6 сентября 1918 года Советом физико-математического факультета он был избран секретарем факультета.
В 1918–1919 учебном году выезжал в Петроград и Вильно для закупки книг, приборов, химреактивов.
Летом 1919 года (в "вакационное время") Ю. С. Залькинд был командирован в г. Томск, на уральские заводы, а осенью и зимой 1920/21 учеб. года - в Петроград и Москву для научной работы и с целью оборудования лабораторий.
Работы относятся к синтезу органической химии:
- Исследования в области каталитического гидрирования ацетиленовых производных в присутствии коллоидного палладия и платиновой черни (1913 г.); установил влияние положения заместителя в основной цепи на скорость гидрирования.
- Большая группа исследований посвящена магнийорганическим соединениям. Ряд работ посвящен изучению ароматических многоядерных производных.
- Впервые получил йод-фенантрен (1927 г.), предложил оригинальный способ синтеза фенантриламинов из фенатролов.
- Синтезировал и изучил (1930-1935 гг.) ряд непредельных соединений, близких витамину А.
- Работы в области синтеза различных растворителей, пластификаторов и пластмасс.
- Получил геометрические изомеры гликолей и эритритов ацетиленового и диацетиленового рядов.
По его методам организовано производство камфары (из скипидара), тетрахлорфталевой кислоты, стирола и т. п.
Заслуженный деятель науки и техники РСФСР (1947 г.).
Скончался в 1948 году. Похоронен в Санкт-Петербурге на Литераторских мостках Волковского кладбища.