Его карьера в качестве сценариста немых фильмов началась в 1918 году - фильм «Однажды в каждом человеке». За свою карьеру в киноиндустрии он принимал участие в создании 90 фильмов и работал со многими известными режиссёрами немого кино и начала эры звукового кино.
4 мая 1927 Джозеф Фарнэм был одним из 36 членов-учредителей Американской академии кинематографических искусств и наук (AMPAS), которые проводили церемонию Оскар 1929 года. Фарнэм единственный, кто получил «Оскар» за лучшие титры, потому что эта награда вручалась лишь один раз на первой церемонии.
Он умер 2 июня 1931 от сердечного приступа в Лос-Анджелесе, штат Калифорния, и был похоронен на кладбище Форест-Лаун в Глендейле, штат Калифорния.