Гражданская войнаС ноября 1918 года служил в рядах РККА.
В 1919 году закончил закончил 1-е командные пехотные курсы.
С мая 1919 года Аменев принимал участие в Гражданской войне и служил в 170-м стрелковом полку (вскоре переименованном в 50-й) в составе 17-й бригады 6-й стрелковой дивизии на должностях помощника начальника и начальника пулеметной команды, командира взвода пешей разведки и начальника пешей разведки полка. С февраля 1920 года Аменев в этой же бригаде служил на должностях начальника по сбору оружия, для поручений отделения связи и командира комендантского взвода.
Принимал участие в боях войск под командованием генерала Н. Н. Юденича под Петроградом, с мая по сентябрь 1920 года - в боях советско-польской войны в районе городов Полоцк и Лепель, в Варшавской операции, а затем на гродненском направлении. С октября 1920 по февраль 1921 года воевал против белогвардейских формирований в районе городов Лепель и Сенно.
Межвоенное времяС августа 1921 года командовал взводом в 50-м стрелковом полку 6-й стрелковой дивизии. В марте 1922 года был назначен на должность делопроизводителя штаба ЧОН МВО, в мае - на должность командира взвода 2-го батальона 2-й Московской бригады ОН.
С августа 1922 года учился в Восточной Объединённой военной школе 2-й ступени, а с марта 1923 года - на повторных курсах среднего комсостава Западного фронта в Смоленске.
С мая 1923 года служил в 6-м стрелковом полку на Западном фронте (в апреле 1924 года преобразован в ЗапВО, а в октябре 1926 года - в БВО) на должностях командира взвода, помощника командира роты, командира хозяйственной роты, командира стрелковой роты и начальника штаба стрелкового батальона.
В 1930 году закончил курсы усовершенствования комсостава «Выстрел».
В декабре 1931 года Аменев был назначен на должность помощника начальника 1-й части штаба 2-ю стрелковую дивизию. С мая 1932 года проходил обучение на курсах по разведке при 4-м управлении Штаба РККА, по окончании которых вернулся в эту же дивизию и был назначен на должность начальника 2-й части штаба дивизии.
С февраля 1938 года временно исполнял должность командира 4-го стрелкового полка. В января 1939 года был назначен на должность помощника начальника штаба этой дивизии, затем - на должность старшего помощника начальника разведывательного отдела Минской армейской группы войск, а в апреле 1939 года - на должность председателя Минского областного совета Осоавиахима.
В 1940 году закончил два курса вечернего факультета Военной академии имени М. В. Фрунзе.
Великая Отечественная войнаВ июле 1941 года полковник Алексей Фёдорович Аменев был назначен на должность командира 871-го стрелкового полка в составе 276-й стрелковой дивизии ОрВО, а в августе включённого в состав 51-й отдельной армии. С февраля 1942 года полковник Аменев временно исполнял должность командира 276-й стрелковой дивизии (СКВО). С марта дивизия в составе 44-й армии Крымского фронта принимала участие в боях на Керченском полуострове, в ходе которых отражала многочисленные атаки противника, и, сражаясь в полуокружении, дивизия оставила позиции после получения соответствующего приказа командующего армией. В ходе эвакуации из Крыма Аменев был ранен и госпитализирован. После окончания лечения с июля 1942 года временно исполнял должность командира 302-й стрелковой дивизии Северо-Кавказского фронта. В августе дивизия была включена в состав 51-й армии (Сталинградский фронт) и участвовала в Сталинградской битве. 14 августа дивизия была выведена в резерв армии. С сентября того же года Аменев исполнял должность начальника штаба тыла 51-й армии, а с февраля 1943 года находился в распоряжении командующего войсками Южного фронта и выполнял задания по линии тыла.
В июне 1943 года был назначен на должность начальника штаба 55-го стрелкового корпуса. С 19 по 27 июня полковник Аменев временно командовал этим корпусом в ходе его формирования в составе 28-й армии Южного фронта. В августе того же года был назначен на должность заместителя командира сначала 151-й, а затем 295-й стрелковых дивизий.
С января 1944 года проходил обучение в ходе ускоренного курса Высшей военной академии имени К. Е. Ворошилова, по окончании которого в декабре 1944 года был назначен на должность инспектора пехоты Красной Армии при НКО СССР.
Послевоенная карьераВ мае 1945 года Аменев был назначен на должность начальника военной кафедры Высшей центральной школы ЦК ВЛКСМ.
Полковник Алексей Фёдорович Аменев в 1946 году вышел в запас. Умер 15 января 1971 года в Москве.