Окончил Уфимское училище искусств (класс Н. Латышевой), продолжил обучение в Казанской государственной консерватории (класс Е. В. Михайлова). С 2006 года по 2009 год- аспирант Московской государственной консерватории им П. И. Чайковского в классе профессора В. В. Горностаевой.
Лауреат международных конкурсов в России, Литве, Италии. Обладатель почетной награды Сирии «За вклад и развитие академической музыки в Сирийской Арабской Республике». Является автором ряда академических музыкальных произведений разных жанров, которые пользуются большим успехом у слушателей и критики. Также является автором нескольких аналитических статей в области геополитики на Ближнем Востоке, философского эссе об искусстве и нескольких произведений малой литературной формы. С 2010 по 2012 год работал в Дамасской Государственной Консерватории профессором кафедры специального фортепиано. Вел класс композиции и эстетики. Приглашенный консультант по вопросам педагогики Консерватории Хассана Ямина в Ливане с 2010 года. Работал в качестве члена жюри от России на V Международном Конкурсе Пианистов им. Сольхи аль Вади в Дамаске в 2012 году.
Репертуар М. Губайдуллина широк: от музыки барокко до сочинений современных авторов. Особое место в репертуаре занимают сочинения К. Дебюсси.
М. Губайдуллин - автор фортепианных миниатюр, двух сонат для фортепиано, трио для фортепиано, фагота и валторны «Сириана», вокального цикла для меццо-сопрано и фортепиано, монодраммы «Конец» на стихи Б. Пастернака для меццо-сопрано и фортепиано и др.
Исполнительский стиль М. Губайдуллина отличается интеллигентностью и технической оснащенностью без напускного виртуозничества. Пианисту свойственны гибкость, мягкость и естественность высказывания. Его игру отличает осмысленное исполнение музыки, «вокальность» звука, глубокое духовное прочтение произведений; в каких-то моментах философская сдержанность и аскетизм, а в каких-то мальчишечий задор и бравурность.