Родился в семье крестьянина. С 1913 года член Украинской партии эсеров (позже УКП «боротьбистов»), в 1920 году вступил в КПУ (зачёт партстажа с 1918).
В 1914 году окончил военно-фельдшерскую школу в Киеве, вёл революционную работу в действующей армии. В 1917-1918 годах член Киевского Совета и ревкома.
После гражданской войны - на советской и партийной работе: председатель Черниговского губисполкома, Всеукраинского союза сельхозкооперации, Киевского окружного исполкома и Киевского горсовета, председатель Киевского губисполкома.
В 1927-34 секретарь ЦК КП(б)У, кандидат в члены Политбюро ЦК КП(б)У. Одновременно с 1933 заместитель, с 28 апреля 1934 по 30 августа 1937 председатель СНК УССР. Делегат 15-17-го съездов ВКП(б), на 17-м - избран кандидатом в члены ЦК ВКП(б). Член ЦИК СССР. Награжден орденом Ленина.
В условиях «культа личности» и усиления политических репрессий на августовском пленуме ЦК КП(б)У был необоснованно обвинён в руководстве контреволюционной националистической организацией на Украине. Любченко отверг все обвинения. Во время перерыва в работе пленума он вернулся домой, застрелил свою жену, после чего покончил с собой.