Родился 16 мая 1866 года в дворянской семье - ветви семьи Саблуковых, из которых происходит переводчик Корана Саблуков, Гордий Семёнович.
Закончил Московский университет (1890 год).
С 1893 до 1895 года был приват-доцентом кафедры международного права в Казанском университете.
В 1895 году защитил магистерскую диссертацию на тему: «Договорные реки. Очерки истории и теории международного речного права».
В 1895-1896 годах находился в заграничной командировке для работы в европейских библиотеках. По результатам командировке опубликовал фундаментальный научный труд «Всеобщие административные союзы государств» (Т. 1-3. Одесса, 1897), первый том которого стал его докторской диссертацией.
С 1896 года по 1919 год - преподаватель международного права в Новороссийском университете, профессор.
С приходом в Новороссийский университет Казанского начинают занимать вопросы не только международного, но и государственного права, в частности, проблемы юридической природы русской монархии.
Казанский был активным деятелем так называемого «Академического движения», состоящего из профессоров правых взглядов, боровшихся против вовлечения университетов в революционную борьбу. Был одним из организаторов одесского отдела Всероссийского национального союза.
В дальнейшем (после 1919 года) - преподаватель в ВУЗах Одессы. Репрессиям со стороны Советской власти подвергнут не был, но возможности публиковать научные труды (которые продолжал писать и после установления Советской власти в Одессе) был лишён.
Скончался в 1947 году (дата смерти точно не выяснена).
В октябре 2010 года в Одесской национальной юридической академии прошли 1-е Международные чтения по международному праву, посвящённые памяти профессора Императорского Новороссийского университета Петра Евгеньевича Казанского. С тех пор данные чтения проходят ежегодно.