«Вулверхэмптон Уондерерс»В 1996 году футболиста пригласили в клуб «Вулверхэмптон Уондерерс». Проведя год в дублирующей команде «волков», Ли дебютировал в основном составе 12 октября 1997 года в матче против «Бирмингем Сити». Выступая на позиции левого защитника, Нейлор прочно закрепился в основе «Вулверхэмптона», став одним из ключевых игроков клуба. Внёс весомый вклад в выход «Уондерерс» в высший английский дивизион в 2003 году, когда «волки», уверенно пройдя всю дистанцию Чемпионата футбольной лиги, в финальном матче переходного турнира победили «Шеффилд Юнайтед» со счётом 3:0.
В чемпионате Англии сезона 2003/04 Нейлор сыграл во всех 38 играх клуба. «Волки» же по итогам года, оказавшись на последнем месте в турнирной таблице, покинули элитный дивизион. Под руководством Гленна Ходлла Ли играл в составе «Уондерерс» ещё два сезона, постоянно пользуясь интересом со стороны других клубов.
«Селтик»23 августа 2006 года он перешёл в шотландский клуб «Селтик», подписав 3-летний контракт. Сумма сделки составила 600 тысяч фунтов стерлингов, к тому же «кельты» отдали «волкам» Чарли Малгрю. Нейлор сразу же стал игроком основного состава «бело-зелёных», выиграв с ними первенство Шотландии 2006/07. Признание его игроком месяца в октябре 2006 года плюс хорошая, стабильная игра в сезоне принесли ему номинацию на звание Игрока года Премьер-лиги. Также в этом году Ли выиграл с «Селтиком» Кубок страны и дебютировал в Лиге чемпионов, проведя в ней все матчи «кельтов». Первый гол за «бело-зелёных» Нейлор забил 1 марта 2008 года в ворота клуба «Хайберниан», второй мяч Ли провёл через год, 2 марта 2009 года, в матче своей команды с «Данди Юнайтед».
4 мая 2010 года в своём сотом, и как оказалось впоследствии последнем, матче в шотландской Премьер-лиге Ли отличился в третий раз за «Селтик» - поразив со штрафного удара ворота «Рейнджерс» в дерби «Old Firm», он стал одним из творцов победы «кельтов» над своими злейшими врагами. Поединок прошёл в упорной, бескомпромиссной борьбе и закончился со счётом 2:1 в пользу «бело-зелёных».
1 июля, по истечении своего контракта с «Селтиком», Нейлор покинул глазговский клуб и стал свободным агентом.
«Кардифф Сити»В июле 2010 года Ли начал предсезонный подготовку со своим бывшим клубом - «Вулверхэмптоном». Руководство «волков» сразу же пресекло, появившиеся в прессе слухи о скором подписании защитника «Уондерерс», заявив, что Нейлор тренируется с командой лишь для поддержания своей спортивной формы.
19 августа было объявлено, что Ли стал игроком клуба «Кардифф Сити», успешно пройдя просмотр, длившийся несколько недель.
Уже 21 августа состоялся дебют Нейлора в первом составе «ласточек» - в этот день соперником валлийцев был «Донкастер Роверс». 14 сентября Ли забил свой первый гол за «Кардифф», поразив ворота «Лестер Сити».
Клубная статистика| Клуб | Сезон | Чемпионат | Кубок | Кубок Лиги | Плей-офф Лиги | Еврокубки | Итого |
|---|
| Игры | Голы | Игры | Голы | Игры | Голы | Игры | Голы | Игры | Голы | Игры | Голы |
|---|
| Вулверхэмптон Уондерерс | 1997/98 | 16 | 0 | 4 | 1 | 1 | 0 | - | - | - | - | 21 | 1 |
|---|
| 1998/99 | 23 | 1 | - | - | 4 | 0 | - | - | - | - | 27 | 1 |
|---|
| 1999/00 | 30 | 2 | 3 | 0 | 2 | 0 | - | - | - | - | 35 | 2 |
|---|
| 2000/01 | 46 | 1 | 2 | 0 | 5 | 0 | - | - | - | - | 53 | 1 |
|---|
| 2001/02 | 27 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | 27 | 0 |
|---|
| 2002/03 | 32 | 1 | 4 | 0 | 2 | 0 | 3 | 1 | - | - | 41 | 2 |
|---|
| 2003/04 | 38 | 0 | 2 | 0 | 3 | 0 | - | - | - | - | 43 | 0 |
|---|
| 2004/05 | 38 | 1 | 2 | 0 | 1 | 0 | - | - | - | - | 41 | 1 |
|---|
| 2005/06 | 41 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | - | - | - | - | 43 | 1 |
|---|
| 2006/07 | 3 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | 0 |
|---|
| Всего за «Вулверхэмптон» | 294 | 7 | 18 | 1 | 19 | 0 | 3 | 1 | 0 | 0 | 334 | 9 |
|---|
| Селтик | 2006/07 | 32 | 0 | 5 | 0 | 1 | 0 | - | - | 8 | 0 | 46 | 0 |
|---|
| 2007/08 | 33 | 1 | 3 | 0 | 2 | 0 | - | - | 9 | 0 | 47 | 1 |
|---|
| 2008/09 | 23 | 1 | 2 | 0 | 2 | 0 | - | - | 3 | 0 | 30 | 1 |
|---|
| 2009/10 | 12 | 1 | 2 | 0 | - | - | - | - | 5 | 0 | 19 | 0 |
|---|
| Всего за «Селтик» | 100 | 3 | 12 | 0 | 5 | 0 | 0 | 0 | 25 | 0 | 142 | 3 |
|---|
| Кардифф Сити | 2010/11 | 27 | 2 | 2 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | - | - | 31 | 2 |
|---|
| 2011/12 | 2 | 0 | 1 | 0 | 3 | 0 | - | - | - | - | 6 | 0 |
|---|
| Всего за «Кардифф Сити» | 29 | 2 | 3 | 0 | 4 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 37 | 2 |
|---|
| Аккрингтон Стэнли | 2013/14 | 13 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | 14 | 0 |
|---|
| Всего за «Аккрингтон Стэнли» | 13 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 14 | 0 |
|---|
| Дерби Каунти | 2013/14 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | 4 | 0 |
|---|
| 2014/15 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | - | - | 1 | 0 |
|---|
| Всего за «Дерби Каунти» | 4 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 | 0 |
|---|
| Всего за карьеру | 440 | 12 | 35 | 1 | 28 | 0 | 4 | 1 | 25 | 0 | 531 | 14 |
|---|
(откорректировано по состоянию на 3 января 2015)
Во время своего пребывания в «Вулверхэмптоне» сыграл три матча за молодёжную сборную Англии.
Через пять лет выдав фантастический сезон за «Селтик», Нейлор привлёк внимание бывшего в то время наставником первой английской команды, Стива Макларена, который всерьёз рассматривал привлечение Ли в ряды в ряды «трёх львов». Однако последовавшая вскоре череда травм защитника не дала этому сбыться.