Геннадий Фатин родился 27 января 1929 года в селе Ново-Черниговка Озинского района Нижне-Волжского края (ныне Саратовская область). Мать Фатина Анастасия Дмитриевна работала дояркой в совхозе «Озерки». Отец умер, когда Геннадию не было и года. В 1937 году пошёл в школу, где отучился 4 класса. Дальше продолжать учиться не мог из-за материальных проблем в семье. В 1944 году переехали в село Дергачи, где и начал трудовую деятельность в колхозе имени XVII партсъезда. При заправке трактора по неосторожности получил тяжелейшие ожог третьей степени. Пролежав в больнице год и 2 месяца, был выписан. В 1946 году поступил в Энгельсское железнодорожное училище по специальности «слесарное дело». В 1948 году, после окончания учёбы, был направлен в локомотивное депо станции Ершов, где и работал слесарем.
В 1966 году Указом Президиума Верховного Совета СССР Г. Ф. Фатину присвоено звание Героя Социалистического Труда с вручением ордена Ленина и медали «Серп и Молот». В 1967 году был депутатом Ершовского горсовета. В 1968 году избран депутатом райсовета. В 1970 году по семейным обстоятельствам был переведён в локомотивное депо Саратов, где и работал до ухода на заслуженный отдых.
Умер в Саратове 12 сентября 2003 года на 75-м году жизни.