Нисимура родился в префектуре Акита, расположенной в северном регионе Тохоку. Он окончил Военную академию Императорского флота Японии в составе 39-го выпуска, 21-м из 148 кадетов. В звании мичмана служил на крейсере «Асо» и эскадренном броненосце «Микаса». После производства в лейтенанты снова переведён на «Асо», затем переведён на линейный крейсер «Хиэй».
Посещал артиллерийскую и торпедную школу в 1914-1915, затем был назначен на эскадренный миноносец «Югири» (англ.)русск., крейсер «Якумо» и линейный крейсер «Харуна».
В 1917 году Нисимура получил звание старшего лейтенанта, специализировался в навигации, служил старшим штурманом на нескольких кораблях, включая корвет «Ямато» (англ.)русск., эсминцы «Таникадзэ», «Юра» и «Суносаки» (яп.)русск., крейсеры «Китаками» (англ.)русск. и «Ои» (англ.)русск., броненосец «Хидзэн». В 1928 году Нисимура был повышен до капитана 3-го ранга. Занимал пост старшего штурмана на крейсере «Ниссин». 1 ноября 1926 года Нисимура получил под командование свой первый корабль - эсминец «Кику». Затем Нисимуру назначали последовательно командиром эсминцев «Вакатакэ» (яп.)русск., «Уракадзэ» (англ.)русск., «Микадзуки» (англ.)русск., и, после повышения до капитана 2-го ранга в 1929 году, «Сиракумо» (англ.)русск.. В 1930-х был назначен командующим 26-й группой эсминцев.
В 1934 году повышен до капитана 1-го ранга, недолго командовал 19-й группой эсминцев, затем - тяжёлым крейсером «Кумано» (англ.)русск. (1937-1938) и линкором «Харуна» (1938-1940). Повышен до контр-адмирала 15 ноября 1940 года, до вице-адмирала - 1 ноября 1943 года.
Во время сражения в Яванском море Нисимура командовал 4-й эскадрой. В июне 1942 года он был назначен командующим 7-й дивизией крейсеров, которая участвовала в битве за Гуадалканал.
В конце войны Нисимура был назначен командующим «южного соединения» in «Operation Sho-Go», которое должно было помочь окончательно разбить флот США у Филиппин. Под командованием Нисимуры оказались следующие корабли: линкоры «Фусо» и «Ямасиро», тяжёлый крейсер «Могами», а также эскадренные миноносцы «Сигурэ», «Митисио», «Асагумо» и «Ямагумо». В проливе Суригао между Лейте и островами Динагат вечером 24 октября 1944 года соединение Нисимуры сразилось с 7-м флотом США, которым командовал адмирал Джесси Олендорф (англ.)русск.. Флот американцев состоял из шести линкоров, восьми крейсеров, 29 эскадренных миноносцев и 39 торпедных катеров. Силы Нисимуры были уничтожены благодаря тактике «Т». Нисимура погиб вместе со своим флагманским кораблём «Ямасиро», потопленным торпедно-артиллерийским огнём американцев.